DTI影像简介
基本概念
DTI(Diffusion Tensor Imaging),即弥散张量成像,是MRI的一种特殊形式。如果说核磁共振成像是追踪水分子中的氢原子,那么弥散张量成像便是依据水分子移动方向制图。DTI是目前惟一能够有效观察和追踪脑白质纤维束的非侵入性检查方法,能以三维的形式显示活体脑白质纤维束,能够立体、直观的显示纤维束的走形变化,从而实现对人的神经纤维精细成像。弥散张量成像图主要用于脑部尤其对白质束的观察、追踪, 脑发育和脑认知功能的研究, 可以揭示脑瘤如何影响神经细胞连接,引导医疗人员进行脑部手术的术前计划和术后评估。
数据参数
1. 平均弥散率:MD(Mean Diffusivity)
MD反映分子整体的弥散水平(平均椭球大小)和弥散阻力的整体情况。MD只表示弥散的大小,而与弥散的方向无关。MD越大,说明水分子扩散能力越强,即组织内所含自由水分子越多。
2. 各向异性程度: FA(Fractional Anisotropy)
部分各向异性指数,是水分子各向异性成分占整个弥散张量的比例,它的变化范围从0~1。0代表弥散不受限制,比如脑脊液的FA值接近0; 对于非常规则的具有方向性的组织,其FA值大于0,例如大脑白质纤维FA值接近1。脑白质中FA值与髓鞘的完整性、纤维的致密性及平行性呈正相关。
3. 相对各向异性指数RA(Relative Anisotropy)
其中,
相对各向异性指数,是弥散张量的各向异性部分与弥散张量各项同性部分的比值。它的变化范围从0(各向同性弥散)到√2(无穷各向异性)。
4. VR(Volume Ratio) 容积比指数
VR(Volume Ratio) 容积比指数,是椭圆体的体积与半径为平均扩散率的球体体积的比值。由于它的变化范围从1(即各向同性弥散)到0,所以临床上更倾向于应用1/VR。VR值越接近1说明水分子的弥散越趋于各向同性。
DTI的定量研究
FA —— 部分各向异性
MD —— 平均弥散系数
AD —— 轴向弥散系数
RD —— 径向弥散系数
PANDA软件简介
PANDA(a Pipeline for Analysis braiN Diffusion images)是由北京师范大学龚高浪教授团队开发的一个全自动处理DTI数据的软件包,可以用来计算DTI的相关参数和进行纤维追踪。
PANDA软件安装
- 环境要求:Linux操作系统(建议使用Ubuntu),MAC操作系统。
- 安装MATLAB和FSL
Ubuntu系统下安装MATLAB的步骤参照:
Linux系统Ubuntu16.04安装MATLAB的详细步骤
FSL的安装参照:
https://blog.csdn.net/qq_26681017/article/details/81636579
PANDA下载及安装
可参照PANDA用户手册或
https://blog.csdn.net/yayacy/article/details/82812696
注意将PANDA的路径添加到MATLAB的PATH中!
PANDA的使用
- 打开方式
在终端打开MATLAB(如果安装MATLAB时设置好,在终端输入MATLAB命令即可直接打开MATLAB软件)。MATLAB软件打开后,在MATLAB的命令窗口输入PANDA,即可弹出PANDA的操作界面。 PANDA软件界面的具体操作可参照视频教程:
http://home.52brain.com/forum.php?mod=viewthread&tid=16455&extra=page%3D2%26filter%3Dtypeid%26typeid%3D27%26typeid%3D27 http://home.52brain.com/thread-16601-1-1.html
- 对输入的要求
PANDA支持两种格式的输入:DICOM文件或NIfTI(即nii格式)影像。
注意:
1)每位患者的文件夹下只放DTI影像或DWI影像
2)每个子文件夹存放一次扫描的数据
3)子文件数=扫描次数
4)如果输入的是NIfTI格式的影像,则每位患者的文件夹下需包含三个文件(*bval*,*bvec*,和*.nii/*.nii.gz)。
3. 结果解读
PANDA输出结果解读: PANDA输出结果介绍详见用户手册《PANDA Resultant Files Description》
注:我们所用的是存放在个体空间native_space文件夹中的结果数据。 FA、AD、MD、RD